Το πρόγραμμα ΕΥΖΗΝ υλοποιείται με βάση τρεις άξονες:
1. Την αξιολόγηση παραμέτρων υγείας σε παιδιά και έφηβους,
2. Την ενημέρωση/εκπαίδευση μαθητών, γονέων, εκπαιδευτικών και φορέων, καθώς και
3. Την παρέμβαση στο σχολείο, την οικογένεια, και το σύνολο της κοινωνίας.
Με βάση τους άξονες αυτούς, τo EYZHN πραγματοποιεί ποικίλες δράσεις και ενέργειες παρέχοντας διαρκή συμβουλευτική ενημέρωση και εκπαίδευση σε μαθητές, γονείς και εκπαιδευτικούς.